Les microbiologistes qui désirent exercer comme professionnel au Québec et accéder à un niveau d'excellence dans la pratique de la microbiologie peuvent présenter leur candidature aux différents programmes de reconnaissance et d'encadrement professionnel.
L'AMQ favorise la protection du public en encadrant l'exercice de la microbiologie par ses membres. Le titre professionnel de microbiologistes agréé est réservé uniquement aux membres de l’AMQ. Ce titre est une reconnaissance du haut niveau de responsabilité que l’AMQ accorde à ses membres et un gage de leurs compétences et de leur professionnalisme.
Le Collège administre plusieurs programmes de certification nationale à l'intension des microbiologistes canadiens, dans le but d'établir les normes de qualification professionnelle requises pour exercer la microbiologie au Canada.
Au Québec, la Loi confit expressément à l'Ordre des chimistes le mandat d'assurer la protection du public dans le domaine de la chimie et de ses différentes spécialités, dont la biochimie. Les membres de l'Ordre ont le droit exclusif d'exercer la chimie et de porter les titres de chimiste, biochimiste ou une abréviation de ceux-ci.
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